[4]​ En mayo de 2016, Facua se personó como acusación popular en la causa que la Sala 4 Penal de la Audiencia Nacional abrió contra Luis Pineda, Manos Limpias y Ausbanc[5]​ por extorsión y otros delitos.

El juez absolvió a los demandados al considerar probados los hechos publicados.

La Asociación demandó a sus abogados al considerar que debían devolver parte de los 80 000 euros cobrados por su trabajo.

La Audiencia Provincial tras comprobar que Facua recibió 305 000 euros de sus socios y subvenciones para esta demanda consideró que dichos honorarios eran correctos.

[15]​ En abril del 2022 la Audiencia Nacional ordenó investigar si Facua daba de alta socios sin su autorización, tras detectar que era una práctica habitual en la organización.