En 1489, el primer año bajo el control veneciano, los turcos atacaron la península de Karpasia, saqueando la isla y tomando cautivos para venderlos como esclavos.

Temiendo la continua expansión del imperio otomano, los venecianos habían fortalecido Famagusta, Nicosia, y Kyrenia, pero la mayoría de las ciudades eran presa fácil.

Se difundieron noticias sobre la masacre, y unos días más tarde Mustafa tomó Kyrenia sin tener que disparar un tiro.

Sin embargo, la victoria sobre los turcos llegó demasiado tarde, y Chipre quedó bajo el gobierno otomano duranto los próximos tres siglos.

Chipre también fue dividido en varios kazas: Tuzla, Limasol, Episkopí, Kythrea, Pafos, Kouklia, Lefka, Morfou, Hirsofu, Famagusta, Kyrenia y Mesariye.

De este modo solicitó un cambio en el estado administrativo dado que Chipre no podía seguir siendo un eyalato.

En 1764, el muhasil Çil Osman Agha fue asesinado en medio de un entorno caótico causado por su gobierno.

Estos nuevos muhasiles ya no tenían algunos de sus viejos poderes, los cuales habían aumentado bastante la influencia del clero ortodoxo mientras recolectaban impuestos.

Se estableció un concejo administrativo de sanjacados representado proporcionalmente por turcos, griegos y otras minorías.

La mayoría de los turcos que se habían establecido en la isla durante los tres siglos del gobierno otomano se quedaron allí cuando el control sobre Chipre —aunque no su soberanía— fue cedido al Reino Unido en 1878.

[cita requerida] La distinción entre los dos grupos se daba a la vez por religión e idioma.

Los otomanos aplicaron el sistema de millets en Chipre, el cual permitió que las autoridades religiosas gobiernen a sus propias minorías no musulmanas.

Como intercambio del control sobre Chipre, el Reino Unido aceptó apoyar a Turquía en la guerra ruso-turca.

Durante la era otomana, en Chipre se construyeron numerosas mezquitas, iglesias, baños públicos, bazares, caravasares, medrasas, escuelas y bibliotecas.

Estos edificios fueron modificados luego por el uso y así se sintetizaron con elementos claramente otomanos.

La administración otomana trajo una mejora significativa a Chipre en cuanto al suministro de agua.

Entre los pueblos descritos como prósperos debido al riego artificial tras la toma británica de la isla están Morfou, Lapithos, Polis, Lefka, Avdimou y Kolossi.

En Karavas, las corrientes se desviaban a canales artificiales para suministrar agua al pueblo.

En el siglo XIX una serie de gobernadores otomanos emprendieron un esfuerzo importante para aplanar y regular el curso del Pedieos.