Estudia ciencias naturales con Henri Milne-Edwards, Claude Bernard y Lacaze-Duthiers, en Universidad de La Sorbona (París - Francia).

Al graduarse dedicó su vida al estudio de los arácnidos, campo poco desarrollado para su época adicionalmente fue especialista en colibríes, crustáceos, insectos, y hongos.

Aunque le enviaban especímenes de diversos países, viajaba con frecuencia porque intuía que, por desconocimiento, los coleccionistas aficionados desechaban ejemplares no atractivos, también importantes.

Eugène Simon trabaja considerablemente en esclarecer la taxonomía y describió numerosas nuevas especies.

Escribió 328 estudios sobre arácnidos y 2 sobre crustáceos, publicados en: La abreviatura Simon se emplea para indicar a Eugène Simon como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.