Lista de los diez equipos que se quedaron primero y segundo en sus respectivos grupos, once con el tercero del grupo D porque ese grupo estaba confirmado por cinco clubes que pasó directamente y el Santo Domingo el último clasificado con Municipal Ahuaycha como mejor tercero completando doce los clubes que se disputarán los otros partidos para clasificar primero y llegar al cuadrangular final.
Los doce equipos quedaron sorteados en tres grupos A, B, y C con cuatro equipos de los cuales clasificarán uno por grupo más el mejor segundo para disputar el cuadrangular final.
(*) Unión Pilcomayo y Defensor Concepción quedaron igualados con 5 puntos por lo que jugaron el desempate y el ganador disputará el cuadrangular final, pasando como primero del grupo B.
Unión Pilcomayo quedó sin posibilidad de clasificar, al caer en la tanda de penales (**) Juventud Apatina ganó por Walkover 3-0 a Unión Sangani, club que no salió a la cancha.
El cuadrangular final cuenta con cuatro equipos provenientes de la segunda fase, tres que clasificaron como primero y uno como mejor segundo de los grupos A, B y C.[6][7]