La estación, diseñada por Payen, abrió sus puertas en 1869, aunque una antigua estación conocida como la estación des Bogards/Bogaardenstation había existido desde 1840 cerca de la Place Rouppeplein en la parte sur de la ciudad.
Esta estación fue demolida 29 años después por ser demasiado pequeña.
En 1949 la estación original fue demolida y reemplazada por el actual edificio amarillo, el motivo del cambio fue el proyecto de conexión ferroviaria norte-sur.
La estación de metro, cuyo nombre oficial es Gare du Midi/Zuidstation, corresponde a las líneas 2 y 6 del Metro de Bruselas.
Desde esta estación salen la mayoría de los trenes internacionales: