Tras varios cambios de formato, actualmente integran la Esiliiga diez equipos, jugando todos contra todos cuatro veces.

El equipo campeón a la conclusión de la temporada obtiene el ascenso a la Meistriliiga.

El segundo clasificado disputa una promoción contra el penúltimo clasificado de la Meistriliiga.

Los dos últimos clasificados de la Esiliiga descienden la Esiliiga B (tercera división) y el penúltimo clasificado disputa una promoción contra el tercer clasificado de la Esiliiga B.

El resto de los clubes de la II Liiga, III Liiga y IV Liiga son equipos reservas.