Schwarz era aborigen de Fráncfort del Meno y estudió zoología en la Universidad de Múnich.

Y trabajó en el Museo de Historia Natural de Londres de 1933 a 1937, cuando se mudó a EE.

UU. Se especializó en especies de grandes simios.

A menudo se le atribuye el descubrimiento del bonobo (chimpancé pigmeo) en 1928.

La abreviatura Schwarz se emplea para indicar a Ernst Schwarz como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.