Mildmay, un puritano, intentó originalmente que el Emmanuel fuera un college que entrenara a predicadores protestantes, para rivalizar con las exitosas escuelas católicas que entrenaron a fraile dominicos durante años.
El Emmanuel todavía tiene a unos cuantos estudiantes de teología, pero ahora incluye a muchos estudiantes de una amplia variedad de asignaturas y carreras, y abrió sus puertas a las mujeres en 1979.
El Emma, como se le conoce dentro de la universidad, atrae a un buen número pregraduados, debido a su reputación como college amable (aunque otros muchos colleges se definen a sí mismos de la misma manera).
El Emmanuel ha estado entre los cinco primeros colleges de Cambridge durante los últimos ocho años (2000-2007).
Hasta finales de la década de 1990, estos patos eran en gran parte Mallards, pero un antiguo Director donó unas especies de patos más exóticos, que incluyeron los Carolina, los Mandarín, los Pintail, los Tufted, y los Wigeon.