La Eliminatoria para el Campeonato Sub-16 de la AFC 2016 fue la fase previa que disputaron 45 selecciones sub-17 de la Confederación Asiática de Fútbol para definir a los 16 participantes en la fase final del torneo a celebrarse en India.
La eliminatoria se jugó del 2 al 20 de septiembre y contó con 11 grupos eliminatorios en 11 sedes diferentes.
Los partidos se jugaron en Kirguistán.
Los partidos se jugaron en Vietnam.
Estos fueron los 16 clasificados a la fase final del torneo a disputartse en la India.