Hizo parte de sus estudios en la capital del Chaco donde actualmente vive con su familia.Posteriormente se radicó fuera del Chaco para realizar estudios de posgrado hasta el año 2003.Su equipo de trabajo se integró con jóvenes profesionales que Aguilar introdujo al ámbito público tras formarlos como profesor universitario y coordinador del Consejo Económico y Social y que, hasta la actualidad, continúan integrando los equipos de gobierno de la Provincia del Chaco en diversas posiciones ministeriales.En 2017, en desacuerdo con la conducción del peronismo nacional y provincial, creó el Frente por la Educación y el Trabajo, partido provincial por el que fue candidato a Gobernador del Chaco en las elecciones de 2019, que preside e la actualidad y que en el plano nacional apoyó entonces la candidatura presidencial de Roberto Lavagna.Profesor de la Universidad Nacional del Nordeste: En la actualidad, Eduardo Aguilar se desempeña como docente en la Facultad de Ciencias Económicas, dictando las materias "Microeconomía Avanzada" como profesor titular, e “Historia de las Ideas Políticas y Económicas Argentinas”, como profesor a cargo.