A inicios del siglo XX las dependencias de la municipalidad funcionaban en una antigua casona ubicada en el lugar actual.

Esta casona resultó severamente dañada el año 1936 por un incendio que se inició y destruyó también el edificio del Arzobispado,[1]​ contiguo a la municipalidad.

Es a fines de esa década que se consiguieron los fondos para reconstrucción y en 1938 se materializó dicho edificio con un estilo Neocolonial diseñado por el arquitecto Enrique Benavente, de la Dirección de Arquitectura.

Este edificio junto a otros como el Arzobispado, Caja de Crédito Hipotecario, Banco Central, Estación de Ferrocarriles y el antiguo edificio de la Sociedad Agrícola inspiraron el estilo del Plan Serena, el Neocolonial, casi una década después.

Cabe señalar que en la fachada de la Municipalidad (calle Prat) está inserto el antiguo escudo de la ciudad, que estuvo en la entrada o puerta de La Serena, cuando fue amurallada y fortificada en 1730 para defenderse de ataques corsarios o piratas ingleses y franceses.