En la temporada 2006/07 disputó 32 partidos (31 de titular), marcando 3 goles, jugando 2763 minutos, recibiendo 7 tarjetas amarillas, quedando Campeones.
Además, estuvo inhabilitado las primeras 5 fechas del torneo por no disponer del “transfer internacional”, hecho que le dificultó hacerse con un hueco en el once ideal de Lazaroni.
Edder Pérez, se perderá el Torneo Clausura y la Copa Libertadores 2009 debido a una molestia en su pie derecho que amerita una nueva intervención quirúrgica que lo mantendrá alejado de las canchas entre 3 y 4 meses.
Cuando terminó el torneo lo dejaron en libertad, fichando luego para el Portuguesa FC equipo donde culminó su carrera como futbolista a lo poder recuperarse por completo de sus lesiones en la rodilla.
Después de colgar las botas como futbolista profesional Pérez se dedicó a atender negocios familiares.
Para el 2016 Atlético Chivacoa cambió de nombre a Yaracuy FC.
En Yaracuy el ex internacional vinotinto ha sabido aportar de lo mejor de sí mismo sumando a su corta carrera como técnico dos campeonatos apertura y clausura 2016 , su equipo hoy pelea por un cupo a segunda división.