En una instalación aparte se encuentra el East New York Bus Depot, anteriormente un centro de almacenaje para tranvías.
El material rodante del metro es inspeccionado y mantenido a diario.
Los materiales rodantes pesados son inspeccionados y reparados en el Coney Island Complex.
Partes del East New York Yard datan desde 1885 y la Lexington Avenue Elevated, también data desde que se empezó a construir la estación Broadway Junction, conocida antes como Manhattan Junction o the East New York Loop.
El patio y su configuración de plomo siguen siendo la misma desde antes y después de que la línea de elevada cercana se ampliara, pero se construyeron vías adicionales y una estructura, para que así, durante las horas pico, el patio de maniobras East New York Yard tuviera una conexión directa al Broadway Elevated que se dirigía hacia el oeste, la línea Jamaica al este, la línea Canarsie yendo al este entrando a la Atlantic Avenue, y el Fulton Street Elevated yendo al este y oeste.