No fue hasta después que la línea fue conectada con las vías con dirección hacia Canarsie.Entre la interconexión Broadway y la Avenida Atlantic están las únicas conexiones de la línea Canarsie hacia el resto del sistema, por en medio de rampas conectando la línea Canarsie hacia la línea Jamaica en Manhattan y East New York Yard (y, hasta 1956, la BMT Fulton Street El).Al este de la Avenida Pitkin, la línea Canarsie pasa por la estructura elevada en la cual originalmente era una estructura a nivel en 1906, hasta llegar a la estación de la Avenida Sutter.En la siguiente estación, la Avenida Livonia, la Avenida Livonia elevada de la línea Eastern Parkway pasa la línea pasa sobre ellas, y justo después de este punto hay una conexión de una sola vía hacia Linden Shops, ahora convertida en una vía y en una estructura para instalaciones.Originalmente existían 3 estaciones posteriores a Rockaway Parkway, denominadas: Avenida Flatlands, Avenida L y Canarsie Pier, pero como Rockaway Parkway fue construida como para ser terminal de línea, las 3 estaciones posteriores a ella fueron demolidas La línea Canarsie es una de las dos únicos "shuttle" del servicios S en la ciudad de Nueva York que tiene un solo servicio y no comparte vías con ningún otra línea o servicio; la otra es la línea Flushing, que transporta los trenes del servicio 7.Durante este tiempo, varios autobuses expresos abastecen las áreas que están fuera de servicio.Cuando la línea fue extendida hacia la 8.ª Avenida en 1931, la cadena cero para la línea BMT Q no tuvo que ser trasladada, sino que se cambiaron todas las señales de designación en las cadenas y estaciones de la línea, y la nueva sección fue extendida al oeste desde la misma cadena cero y se le designó la cadena de BMT QW.
El servicio que usa la línea Canarse sobre Manhattan ha sido de color gris desde 1979.
