En septiembre de 1971 se une a The Alan Bown Set, donde conoce al que sería el futuro saxofonista de Supertramp, John Helliwell.
En 1973 se unió formalmente al grupo y colaboró en la gestión de la banda junto a Dave Margereson.
Asimismo sería el encargado de persuadir a Helliwell para que se uniera al grupo.
Utilizó los bajos Music Man Stingray y Fender Precision Bass durante su paso por la banda.
Thomson participaría en la etapa más comercial de Supertramp, incluyendo los álbumes: Cuando el grupo se disolvió de manera temporal en 1988, Thomson comenzaría a trabajar como publicista en la industria musical, creando Trinitry Publishing, y participaría en una empresa de gestión en Chicago (Illinois).