Está considerado como el compositor europeo más famoso que haya viajado hacia América durante el período virreinal, y también el músico más dotado que haya contribuido a las misiones jesuíticas en el continente.
En 1709 completó su formación musical con Bernardo Pasquini en Roma, hasta la muerte de este último.
Falleció en 1726 debido a una enfermedad infecciosa, probablemente tuberculosis, aunque no se conoce ninguna prueba al respecto.
Tanto es así, que hasta ya avanzado el siglo XX todavía se dudaba si "cierto hermano jesuita llamado Domingo Zipoli" tenía alguna relación con el autor europeo de las sonatas para órgano y cémbalo, su obra europea más conocida.
En 1959, el musicólogo estadounidense Robert Stevenson halló, entre esta documentación, copias de una misa en fa mayor atribuida a Zipoli y copiada en Potosí en 1784, probablemente a partir de fuentes jesuíticas locales; hoy sabemos que esta obra es en realidad un arreglo local basado en otras dos misas del compositor, que aparecieron posteriormente.
Este festival internacional, organizado por la Asociación Pro Arte y Cultura (APAC) es considerado como el festival más grande del mundo en su género, así como uno de los acontecimientos musicales más importantes de Bolivia.
Los musicólogos crearon un catálogo completo y sistemático del Archivo Musical de Chiquitos.
Partiendo de las pautas y convenciones establecidas por Burkhardt, los responsables del catálogo optaron por dos enfoques simultáneos: por un lado, organizar las obras por géneros en las carpetas de fotocopias; por otro lado, reconstruir los cuadernillos originales siguiendo criterios históricos, como paso inicial hacia su adecuada restauración.
Asimismo, parece haber estado escribiendo para un público no familiarizado con las convenciones formales y expresivas europeas de la época: busca el efecto directo sin pérdida expresiva, y apela a la sencillez del ensamble sin desmedro del virtuosismo individual.