Contiene todos los subdirectorios de la jerarquía.
Un solo directorio raíz generalmente representa la totalidad de un solo disco.
En sistemas tipo Unix, es notado con el carácter /.
Todos los accesos al sistema de archivos, incluyendo los discos extraíbles, forman parte de toda la jerarquía y son subordenadas en el directorio raíz.
Por otra parte, en los sistemas operativos DOS y Windows cada partición posee un directorio raíz individual (nombrado C:\ para una partición particular C) y no existe un directorio raíz común que los contenga a todos ellos como en los sistemas Unix.