Incluye Giardia lamblia, que causa la giardiasis en seres humanos, y Enteromonas hominis, que parasita el tracto digestivo de humanos y otros mamíferos.
Constituye un orden de la clase eofaríngeos incluido en el clado Excavata.
Es uno de los grupos basales de protistas, se clasifica en Metamonada y parece cercanamente emparentado con Retortamonadida.
La mayoría de los diplomonádidos tienen componentes celulares duplicados a cada lado de la célula, cada parte con su núcleo y cuatro flagelos asociados, dispuestos simétricamente con respecto al eje central del cuerpo.
[2] Se supone que estos organismos proceden de antecesores con mitocondrias y que secundariamente las han perdido.