Antes de casarse tuvo con Isabel María Gallegos (o Márquez) un hijo llamado José Nicolás Próspero de la Haya, quien casó en Cartago, Costa Rica, con María Josefa Chavarría y Calvo.

Los historiadores costarricenses lo han considerado como uno de los mejores gobernadores españoles que tuvo la provincia.

Escribió la obra Norte del Reino de Tierra Firme, que concluyó en 1716 y estaba dedicado al rey Felipe V.

Este libro contenía una detallada descripción de Panamá y sus recursos, pero no se conserva el texto y únicamente se conoce el prólogo.

Tampoco se conserva otro libro que escribió con respecto al posible mejoramiento de Panamá en diversos aspectos.