[1]​ Fue establecido por una ley del Congreso el 30 de abril de 1798, a instancias del secretario de Guerra James McHenry, para proporcionar una estructura organizativa gubernamental a la Armada de los Estados Unidos (USN).

Estas ramas permanecen en todo momento independientes y en igualdad de condiciones dentro del DON.

[2]​ Está dirigido por el secretario de la Marina (SECNAV), un oficial civil Control civil del ejército estatutario.

[3]​ El Departamento de la Marina fue un departamento ejecutivo, cuyo secretario sirvió en el gabinete del presidente, hasta 1949, cuando las enmiendas a la Ley de Seguridad Nacional de 1947 establecieron el Departamento de Defensa como un departamento unificado para todos los servicios militares; El DoN, junto con el Departamento del Ejército y el Departamento de la Fuerza Aérea, se convirtió en un componente del DoD, sujeto a la autoridad, dirección y control del secretario de Defensa.

De 2001 a 2019, se presentaron propuestas para cambiar el nombre del Departamento de la Marina a Departamento de la Armada y el Cuerpo de Marines con amplio apoyo en el Congreso de los Estados Unidos, pero fracasaron debido a la oposición del senador y ex oficial de la Marina de los Estados Unidos John McCain.