En 1990 el presidente George H. W. Bush lo nombró Juez del Primer Circuito de Apelaciones en Boston.
Meses más tarde, Bush lo nominaría a la Corte Suprema tras el retiro del Juez Asociado William J. Brennan.
Durante sus primeros años en la corte, Souter se ganó un reputación de conservador moderado.
Por eso, a pesar haber sido nombrado por un presidente republicano, Souter es considerado hoy en día un juez liberal.
En mayo de 2009 la Casa Blanca anuncia a la juez Sonia Sotomayor como su sucesora.