Cristóbal Núñez fue un médico español de los siglos xvi y xvii.
Nació en Huete (Cuenca) y fue doctor primario de la Universidad de Alcalá de Henares, donde estudió medicina como discípulo de Pedro García Carrero.
[1] Escribió una obra titulada De coctione et putredine: opus eximae erudictionis, tum philosophis, tum medicis, in quo commentantur tria priora capita Arist.
ex Meteo, libro quarto (Madrid, 1613), dedicada a Gabriel Trejo Paniagua y dividida en siete cuestiones.
[1] Residía en México cuando Lope de Vega le dedicó la comedia El alcalde mayor, escrita entre 1604 y 1612.