La máxima RAM se incrementó a 2 GB y era posible tener hasta ocho SESs.
El 2E y el 4E estuvieron disponibles posteriormente con un sistema opcional de refrigeración por aire.
En 1992, Cray lanzó el más económico modelo Y-MP EL (Entry Level, o Nivel de inicio).
Este fue una reimplementación de la arquitectura Y-MP en tecnología CMOS, basado en el diseño S-2 adquirido por Cray a Supertek Computers en 1990.
El Y-MP EL estaba armado en un gabinete mucho más pequeño que el tradicional sistema de Cray que llenaba una habitación ( 2010×1270×810 mm, alto × ancho × largo, y un peso de 635 kg); y podía ser alimentado con un suministro eléctrico regular.