Logroñes) Jimmy Hasselbaink (4 goles) La Copa del Rey de Fútbol 1999-2000 fue la edición número 96 de dicha competición española.

Se disputó con la participación de equipos de las divisiones Primera, Segunda, Segunda B y Tercera, excepto los equipos filiales de otros clubes aunque jueguen en dichas categorías.

El campeón fue el RCD Espanyol, por tercera vez en su historia al vencer en la final disputada en Mestalla al Atlético de Madrid por 2 goles a 1.

Se disputó a partido único en el terreno del equipo que figura en primer lugar.

Dado que era inviable disputar el partido en igualdad de condiciones Pep Guardiola informa al árbitro y al capitán del Atlético de Madrid en el centro del campo ante un Camp Nou prácticamente vacío que se retiran.