Paco Flores

La temporada 1996/97 tuvo su primera experiencia en la Primera División al entrenar al primer equipo del RCD Espanyol desde la jornada 29 hasta el final de la temporada, sustituyendo a Vicente Miera.[1]​ Flores cogió al equipo en zona de descenso y consiguió la permanencia.[4]​ Durante ese tiempo, consiguió una Copa del Rey en el 2000, coincidiendo con el centenario de la entidad blanquiazul.En la temporada 2006-2007, fue contratado como entrenador del Gimnàstic de Tarragona después de que en la jornada 12 fuera destituido Luis César Sampedro por los malos resultados del equipo.[11]​ Aunque mejoró los números de su predecesor, no bastó para lograr la permanencia, certificándose el descenso a falta de 2 partidos para el final del campeonato.