La Copa Intertoto de la UEFA 2000 fue la sexta edición de este torneo de fútbol a nivel de clubes de Europa, organizado por la UEFA y que contó con la participación de 60 equipos de todo el continente.

El torneo dio 3 plazas para la Copa de la UEFA 2000-01, las cuales se las llevaron el Celta de Vigo de España el Vfb Stuttgart de Alemania y el Udinese Calcio de Italia