La Copa Intertoto de la UEFA 1998 es la cuarta edición de este torneo de fútbol a nivel de clubes organizado por la UEFA.

Participaron 60 equipos de asociaciones miembros de la UEFA.

El torneo dio 3 plazas para la Copa de la UEFA 1998-99, las cuales fueron ganadas por el Bologna de Italia,el Valencia de España y el Werder Bremen de Alemania.

A diferencia de todas las ediciones anteriores, en ésta no se iba a jugar la fase de grupos por primera vez en la historia del torneo, ya que se jugó bajo un sistema de eliminación directa a partidos de ida y vuelta, en la que los ganadores avanzaron de ronda.