La Copa Bolivia 2016 fue la quinta versión del torneo promocional de segunda división organizado por la Asociación Nacional de Fútbol de Bolivia para otorgar 3 cupos al campeonato Copa Simón Bolívar 2016-17 .

Se disputó en septiembre de 2016, en la ciudad de Santa Cruz y en la ciudad la Paz.

Participaron los equipos subcampeones de las 9 Asociaciones Departamentales de Bolivia, el subcampeón del Torneo Nacional Interprovincial 2016, los equipos terceros de Potosí y Beni, y como invitado especial, el equipo perteneciente a la ciudad sede de Villamontes, el Club Quebracho.

Los 10 equipos fueron distribuidos en 2 series: Pts = Puntos; PJ = Partidos Jugados; G = Partidos Ganados; E = Partidos Empatados; P = Partidos Perdidos; GF = Goles Anotados; GC = Goles Recibidos; Dif = Diferencia de gol Pts = Puntos; PJ = Partidos Jugados; G = Partidos Ganados; E = Partidos Empatados; P = Partidos Perdidos; GF = Goles Anotados; GC = Goles Recibidos; Dif = Diferencia de gol Para esta edición de la Copa Bolivia la Asociación Nacional de Fútbol de Bolivia determinó que se otorgarían 3 cupos a la Copa Simón Bolívar 2016-17.

Siendo así, y debido a problemas de organización, logística y financiamiento surgidos antes y durante la realización del torneo, se decidió que los 3 cupos se otorgarían directamente a los primeros lugares de cada serie y al mejor segundo.