La Copa Aldao 1946 fue la decimoséptima edición del torneo organizado por AFA y AUF.

Se disputó con partidos de ida y vuelta.

Esta edición se disputó con partidos de ida y vuelta.

Ganaron un partido cada uno y Nacional se consagró campeón ganando la serie por 9 a 5 (3-2 de ida y 7-2 de vuelta).

Fue la edición con más goles convertidos, totalizando un total de 14 anotaciones.