Había también una versión "tower" (torre), llamada A4000T.La placa base no tenía CPU.Máquinas más actuales tenían el CPU montado sobre la placa base, en un esfuerzo por reducir los costos.La versión "tower"(torre) fue el único Amiga que tuvo SCSI e IDE juntos, incorporados a la placa base.Tener el controlador por software para ambas interfaces cargados en ROM significaba que algunas otras partes del sistema operativo AmigaOS debían ser eliminados de la ROM, y la A4000T es la única máquina en tener una biblioteca "workbench" en el disco.