Fundado por los agustinos, su primer local estuvo ubicado en el ahora "Convento de Nuestra Señora de Gracia", también llamado de "San Agustín", en el jirón Ica en el centro histórico de Lima.

Hasta el año 1920 funcionó un internado, con capacidad para alrededor de ochenta (80) alumnos.

En el local inicial permaneció, durante 62 años, hasta 1965.

También se inauguró el pabellón, llamado Sección Infantil, actualmente ocupado por 3º y 4º grados de primaria.

En 1969 se inauguró el gran Coliseo, para acoger a unos 3000 espectadores.

En 1993, se inició la educación coeducativa (hasta 1992 solo era de varones) que en forma progresiva desde inicial fue incrementándose año a año hasta quinto de Secundaria.

Centro Educativo Particular San Agustín.