Sin embargo, su funcionamiento recién se hizo realidad luego que la “Comisión Redactora del Estatuto y Reglamento del Colegio Médico del Perú concluyese su labor y se aprobara el primer Estatuto y Reglamento del Colegio Médico del Perú el 1 de julio de 1969 por Decreto Supremo n.º 00101-69-SA y Decreto Supremo n.º 00102-69-SA respectivamente.
A continuación se logró la inscripción inmediata de 4 972 médicos en todo el país y se procedió a la primera elección de autoridades.
Su primer Consejo Nacional presidido por el primer Decano doctor Jorge de la Flor Valle, se instaló en noviembre de 1969.
[1] La sede del Consejo Nacional está en la Av.
La orden es regida por una directiva o Consejo Nacional que se elige cada tres años.