Sus colores son el rojo, blanco y azul.
El club fue fundado el 16 de noviembre de 1944, diez años después de que dos clubes locales, el Esporte Clube Corinthians y Penápolis Futebol Clube, se retiraran.
[4] El club fue fundado después de que un equipo combinado de Penápolis jugó un partido amistoso en Fernandópolis contra un equipo local combinado.
[4] Penapolense ganó el Campeonato Paulista Série A3 en 2011.
Penapolense manda sus partidos en el Estadio Municipal Tenente Carriço, apodado Tenentão.