A nivel nacional, no destacaría sino hasta el año 1979, donde clasificaría para disputar el Torneo Regional 1979/80, donde sería eliminado velozmente por el club Juventud Unida Universitario de San Luis tras empatar 1-1 la ida como local, pero perder 2-0 como visitante.
Participó varias temporadas en la Cuarta División argentina; jugó las 5 ediciones del torneo Federal B (2014, 2015, 2016, complementario 2016 y 2017) más la primera del Torneo Regional Federal 2019, sumando 6 temporadas consecutivas por Cuarta División.
Ganó ambos cotejos por 2-1 y obtuvo el ascenso a la tercera división por primera vez en su historia.
El día del ascenso, el 16 de junio de 2019, en Chivilcoy, Sportivo Peñarol ascendió con estos jugadores: Carlos Biasotti, Mario Rebeco, Lucas Arturia, Pablo Costi, Francisco Fernández, Roberto Martín, Ernesto Ceballos, Carlos Fernández, Facundo González, Gabriel González y Gustavo Pereira.
En el siguiente partido Sportivo Peñarol convierte el primer gol de su historia en la tercera división, frente a Cipoletti.
Mediocampistas: Francisco Javier Salinas: ex Juventud Alianza (San Juan); Lucas Andrés Saucedo a G.E.C.U.