En la Copa Perú 1970, tras lograr el campeonato departamental de Tumbes, clasificó a la Etapa Regional donde enfrentó a Asociación Bancarios de Jaén, Unión Tumán y Atlético Torino, siendo este último el que avanzó a la Finalísima donde lograría el título.

[2]​ Llegó nuevamente a la Etapa Provincial en 2016 siendo eliminado en la liguilla por Comercial Aguas Verdes y los Chanos.

En la Copa Perú 2022 fue campeón departamental tras vencer en la última fecha a Progresista de Los Pinos por 3-1 y clasificó a la Etapa Nacional donde fue eliminado en dieciseisavos de final por Deportivo Verdecocha con un marcador global de 3-2.

Deportivo Ferrocarril mantiene una rivalidad en su ciudad con Sport Bolognesi dando origen al "Clásico de Zarumilla".

[5]​ El club cuenta con su local propio ubicado en el jirón Independencia Nº 329 en la ciudad de Zarumilla.