[2]​ Disputa los partidos como local en el Campo Municipal de Fútbol Jaime Mata.

Fundado en 1995 tras la fusión del CD Tres Cantos Balompié y CD Embarcaciones, Tres Cantos logró la promoción a la Primera Categoría en su primera campaña.

En 2008, tras la fusión con el CD La Paz, el club logró el ascenso administrativo a Preferente Autonómica.

[3]​ El CDF Tres Cantos ascendió a Tercera División en junio de 2017, tras quedar 3.º en liga esa temporada, salvando la categoría en su debut el siguiente curso.

Al finalizar la siguiente temporada 2023-24, consigue su segunda permanencia en Tercera Federación tras concluir como séptimo clasificado.