El club había jugado las ediciones del Torneo Argentino B en 2000 y 2001, llegando a la fase final.

El nombre de la institución se le debe a la fusión entre Comercio Central y Principiantes Unidos.

Con los colores rojo y negro como emblema, se destacó en sus inicios al quebrar la hegemonía local del Club Atlético Mitre y obtener tres títulos consecutivos en la Liga Santiagueña de Fútbol.

Uno de los logros más recordados del club fue su ascenso al Torneo Federal B en 2014.

Esta histórica campaña le permitió clasificarse para participar en la Copa Argentina 2016-17, un logro que marcó un hito en la historia del club.