Jugaba como defensor y su primer equipo fue Estudiantes de La Plata, donde ganó dos títulos.
Comenzó su carrera como entrenador en Defensores de Cambaceres en 1996, luego trabajó en las divisiones inferiores de Estudiantes de La Plata y en 2003 asumió la dirección técnica de La Plata FC, equipo con el que ganó el Torneo Argentino B, logrando así el ascenso al Torneo Argentino A.
[2] En 2007, tras la salida de Carlos Trullet, se convirtió en el director técnico del primer equipo,[3] llevándolo a disputar la promoción para ascender a Primera División, en la que caería derrotado ante Gimnasia y Esgrima de Jujuy.
[4] En 2009, Alejandro Sabella asume como director técnico de Estudiantes de La Plata y Gugnali junto a Julián Camino pasan a integrar su cuerpo técnico como ayudantes de campo.
También acompañó a Sabella cuando fue elegido entrenador de la Selección Argentina en 2011,[6] en un proceso que duró tres años y que finalizó tras el subcampeonato logrado en el Mundial de Brasil 2014.