Clarkstown se encuentra ubicado en las coordenadas 41°7′34″N 73°58′49″O / 41.12611, -73.98028.

Según la Oficina del Censo, la ciudad tiene un área total de 121,6 km² (46,9 mi²), de la cual 99,8 km² (38,5 mi²) es tierra y 27,7 km² (10,7 mi²) (6.33%) es agua.

Según la Oficina del Censo en 2007 los ingresos medios por hogar en la localidad eran de $92,121, y los ingresos medios por familia eran $104,909.

Los hombres tenían unos ingresos medios de $57,773 frente a los $40,805 para las mujeres.

La renta per cápita para la localidad era de $34,430.