Los dos primeros se conocen con el nombre de procordados, aunque este agrupamiento es un grupo parafilético.Las relaciones filogenéticas entre los subfilos cordados y de ellos con otros deuteróstomos son, según estudios moleculares las siguientes:[9][10] Xenacoelomorpha Echinodermata Hemichordata Cephalochordata Urochordata/Tunicata Vertebrata/Craniata[18] A lo largo del Devónico aparecieron y se diversificaron los peces sin mandíbulas, siendo los primeros vertebrados conocidos.En primer lugar, la masa corporal está intrínsecamente relacionada con la longevidad y la tasa metabólica basal en todos los organismos, incluidos los cordados.Sin embargo, al contrario que en crustáceos y bacterias, el tamaño del genoma en cordados está correlacionado positivamente con la temperatura.[12] Los organismos relacionados más cercanos a los Cordados son los Hemichordata, los Echinodermata y los Xenacoelomorpha, que juntos forman los Xenambulacraria.Aunque el nombre Chordata se atribuye a William Bateson (1885), ya era de uso frecuente en 1880.Aunque utilizó la forma vernácula alemana, está permitido bajo el Código Internacional de Nomenclatura Zoológica debido a su posterior latinización.
