Chiscas en lengua muisca expresa “cenagoso, lugar cenagojo”, “nuestra propiedad".
La palabra pertenece a la lengua Muisca, de donde salen los siguientes posibles vocablos: /chi/ : “nosotros”; /s/ : “por, para”; /ca/ : “lugar, fortaleza, propiedad”.
En esta cuenca se ubican los centros poblados y el grueso de la población.
Específicamente el centro urbano se asienta sobre una meseta originada posterior a la era glacial, horadadas por el curso de los ríos Cucaneba y Litargón.
La mayor parte del territorio del municipio se ubica en una zona montañosa, con rangos que oscilan entre 1800 y 4600 m s. n. m. El territorio hace parte de la Cordillera Oriental en el departamento de Boyacá.
Se encuentra una variedad de flora autóctona, junto a especies introducidas: acacias, alcaparros, algarrobos, arrayanes, chusque, eucalipto, frailejón, guayacán, helecho, pino ciprés, roble, sauco, sietecueros, gaque, urapán y zarcillejo.
También se encuentran arbustos considerados medicinales como: ajo, albahaca, artemisa, caléndula, cidrón, diente de león, llantén, perejil, romero, salvia, tilo, toronjil, itamo real entre otras especies.
Se ha documentado la presencia de los siguientes animales en estado silvestre, muchos de ellos en el territorio del parque nacional natural El Cocuy: fara, guartinajo, oso de anteojos, venado cola blanca, cóndor Andino, murciélago, mirla blanca, garzas, lechuza, zorros, comadreja, perdices, paloma (torcasas) ranas, libélulas, saltamontes, mariposas, abejas, arañas.