La presencia de una bomba nuclear a bordo del tren también presenta un riesgo importante.

No obstante, durante la operación los terroristas acaban con casi todo el equipo, salvo el teniente Jack Morton.

Poco después de entrar en el tren, Jack encuentra al embajador y a su secretario, Philip Mason, en la sala vip del automóvil 10.

Jack regresa a la sala vip para descubrir que los terroristas se lo llevaron y Mason fue noqueado en la lucha.

La historia no es completamente lineal, pues los eventos pueden cambiar durante el curso del juego.