comenzó su carrera a comienzo de los años 1990 y ha editado, hasta el momento, 17 álbumes.

Hunter se graduó en la Berkeley High School y tomó lecciones de guitarra del mismísimo Joe Satriani.

fue con-fundador del grupo Garage A Trois, una banda de jazz fusión, con Stanton Moore y Skerik.

Hunter contribuyó además con tres canciones al álbum de D'Angelo, Voodoo (2000), incluida "The Root".

[3]​ En verano de 2007, Charlie realizó una gira con un trío que incluía al teclista Erik Deutsch y el batería Simon Lott.