Coquerel recolectó insectos en Madagascar y en las islas vecinas.

Una parte de sus descripciones luego de su muerte, fueron publicadas por Léon Marc Herminie Fairmaire (1820-1906) en sus Notes sur les Coléopteres recueillis par Charles Coquerel a Madagascar et sur les côtes d'Afrique, de 1869.

Coquerel fue autor de numerosas publicaciones como un anexo sobre insectos en Voyage à Madgascar au couronnement de Radama II (1865) de Auguste Vinson (1820-1903).

Sus Lettres d'un marin à sa famille aparecen póstumamente en 1870 (Germer-Baillière, París).

Numerosas especies le fueron dedicadas como: La abreviatura Coquerel se emplea para indicar a Charles Coquerel como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.