La quinta iglesia fue dedicada por Joseph Alemany, el Arzobispo de San Francisco, en 1877, mientras que la construcción continuaba.

El actual pórtico se completó en 1884, y la gran bóveda, fue terminada en 1885.

En 1981, un gran proyecto de renovación se inició, en lo que se convertiría en la actual catedral y sede para el nuevo obispo católico de San José California.

En 1985, la iglesia fue elevada a catedral, mientras se finalizaba la restauración en 1990.

La catedral se hizo una basílica menor por parte de Papa Juan Pablo II en 1997.