Canistota es una ciudad ubicada en el condado de McCook en el estado estadounidense de Dakota del Sur.

[3]​ Canistota se encuentra ubicada en las coordenadas 43°35′52″N 97°17′33″O / 43.59778, -97.29250.

Según la Oficina del Censo de los Estados Unidos, Canistota tiene una superficie total de 1.45 km², de la cual 1.45 km² corresponden a tierra firme y (0%) 0 km² es agua.

[4]​ Según el censo de 2010,[5]​ había 656 personas residiendo en Canistota.

De los 656 habitantes, Canistota estaba compuesto por el 94.97% blancos, el 0% eran afroamericanos, el 1.98% eran amerindios, el 0.46% eran asiáticos, el 0.15% eran isleños del Pacífico, el 0.91% eran de otras razas y el 1.52% pertenecían a dos o más razas.