Los diferentes torneos y campeonatos son organizados por la Asociación Paraguaya de Fútbol, y por una asociación afiliada a la misma llamada Unión del Fútbol del Interior (UFI), la cual consta de 17 federaciones, una por cada departamento del país, sin contar a la capital, la ciudad de Asunción.
Hasta el año 1996, solo existían tres divisiones (aparte de las ligas regionales del interior), pero se introdujo la Intermedia en 1997 para integrar a los equipos de la capital y del interior, y permitir a estos últimos clasificar a torneos internacionales.
12 clubes: de la zona metropolitana y/o del interior (UFI) Clasifican a la Copa Libertadores: El campeón del Apertura, el campeón del Clausura, y los dos equipos que hayan obtenido mayor cantidad de puntos sumando ambos torneos y que no sea ninguno de los campeones.
variable (osciló entre 6 y 18) clubes del interior: Los descendidos de la División Intermedia, los clubes provenientes del Clasificatorio de la UFI para la Primera B Nacional o aceptados por reunir las condiciones; y, las selecciones mejor ubicadas (no campeonas) en las Interligas anteriores.
Campeonato Nacional de Interligas (bianual) 156 selecciones, una por cada liga regional La selección campeona debe fundarse como un club unificado y sube a la División Intermedia,[3] además: juega la final de la Copa San Isidro de Curuguaty contra el campeón uruguayo del interior.
(El subcampeón, y eventualmente semifinalistas, disputan desde el siguiente año la Primera B Nacional junto a clubes del interior) 4 Primera División C 12/16 clubes de Asunción y alrededores El campeón y el subcampeón ascienden a la Primera División B.
Los clubes de cualquier liga regional, que cuenten con instalaciones adecuadas pueden solicitar su participación en el Nacional B o en el Clasificatorio de la UFI para el mismo, además optan por seguir jugando o no en su liga respectiva.
Cada selección del interior se conforma con los mejores jugadores de los clubes que componen la liga respectiva.