El club que se consagró campeón del torneo, Caacupeña, ascendió a la División Intermedia, el subcampeón jugó un repechaje contra el subcampeón de la Primera B Metropolitana por el ascenso a la División Intermedia.

[1]​ La primera etapa se jugó con el sistema de todos contra todos, a dos ruedas, los dos equipos de mayor puntaje avanzarán a la segunda fase, en la que se medirá el primero del Grupo A con el segundo del B y viceversa.

El campeón ascendió directamente a la categoría Intermedia del fútbol paraguayo, en tanto que el segundo jugará la Promoción con el subcampeón de la Primera División B.

Esta fase se jugó con el sistema de todos contra todos, a dos ruedas, donde los dos mejores equipos ubicados de cada grupo, clasificaron a la segunda fase.

Tras culminar el torneo, el club subcampeón jugó partidos de ida y vuelta contra el subcampeón de la Primera B Metropolitana 2012 para definir el ascenso a la División Intermedia.