Este formato causaba dificultades económicas en los clubes, por lo que desde 2012 se jugaba cada semana.

Los clubes que descendieron en la Temporada 2008 (Guabirá) y Temporada 2009 (Nacional Potosí) se encuentran actualmente jugando la LFPB, lo cual habilita la participación de Destroyers en este certamen.

Los 2 primeros de cada serie jugaron el cuadrangular final todos contra todos para definir a los 3 primeros equipos con opciones de ascenso directo e indirecto.

Si dos equipos empataban en puntos, debieron jugar un partido en cancha neutral para definir al campeón.

[12]​ El ganador de este partido y campeón de esta edición del Nacional B fue Petrolero que ascendió directamente a la Liga del Fútbol Profesional Boliviano y jugará desde la Temporada 2012-13, mientras que Destroyers jugará el ascenso indirecto con el penúltimo del punto promedio de la Temporada 2011-12.