[2] Durante su única temporada con el Siena (2008-2009) Zúñiga dio impresionantes actuaciones, atrayendo la atención de varios clubes europeos.En la temporada siguiente, fue utilizado como lateral izquierdo en el 4-2-3-1 del nuevo entrenador Rafa Benítez.El 21 de octubre se sometió a una intervención quirúrgica para remover una calcificación en la rodilla derecha.Volvió a jugar después de seis meses y medio, en la penúltima fecha ante Sampdoria.Su salida del club se dio por las constantes recaídas de su lesión en la rodilla y, como consecuencia, los pocos minutos de juego dados por su entrenador en ese momento Rafa Benítez para recuperar su nivel futbolístico.[5] El 17 de enero debutaría jugando 20 minutos en el empate a dos goles frente al Lazio.En la final de la Liga Águila I 2018, entró para jugar los últimos 5 minutos del partido, siendo truncado este objetivo, al hacerse expulsar a los dos minutos de haber entrado al campo de juego; después el equipo rival Deportes Tolima, empató la serie faltando dos minutos para que se acabara el tiempo extra, ganando el partido en los tiros desde el punto penal.Camilo le da una asistencia a Radamel Falcao para que anote el primer gol del partido, y además, convirtió su único gol en las eliminatorias contra Uruguay, luego de una jugada individual sorprendente en la que le hace un túnel a Álvaro Pereira y anotó el 4-0 definitivo a favor de Colombia.fracturándole la tercera vértebra lumbar dejando al jugador sin poder disputar el resto del torneo.
